«Мутация» привносит в динамичный военный шутер элементы непредсказуемости и легкий привкус паники: в противостоянии группировок Black List и Global Risk появляется третья сторона — мутанты, жертвы использования биологического оружия, способные заразить все человечество. И теперь непримиримые противники должны объединиться, чтобы уничтожить угрозу жизни на нашей планете.

В начале раунда случайным образом из числа игроков выбирается так называемый нулевой зараженный - мутант, с которого и начинается эпидемия мутаций. В течение раунда игрок управляя мутантом, может заразить всех остальных и таким образом выиграть раунд, а GR и BL должны объединится и уничтожить всех мутантов.